La referendumul național din 29 iulie 2012 la Penitenciarul Mărgineni și-au exprimat dreptul de vot un număr de 684 persoane private de libertate, din totalul de 907 aflate în custodie. Unitatea este arondată circumscripției electorale nr. 16, secţia de votare nr. 3, I.L.Caragiale. Conform legii, chiar dacă sunt în executarea unei pedepse privative de libertate, deţinuţii care nu şi-au pierdut drepturile electorale, pot vota. La secţia de votare, procesul s-a desfăşurat fără incidente.